Podoviridae

Podoviridae
Systematik
Reich: Viren Ordnung: Caudovirales Familie: Podoviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear Baltimore: Gruppe 1 Symmetrie: ikosaedrisch Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Podoviridae (engl.)
Links
NCBI Taxonomie: 10744 ICTVdB Virus Code: 02.054

Die Virusfamilie Podoviridae umfasst Bakteriophagen der Ordnung Caudovirales mit linearem, doppelsträngigem DNA-Genom von 16-70 kBp Länge, einem 50-70 nm im Durchmesser großen ikosaedrischen Kapsid mit einem kurzen, nicht-kontraktilen Schwanzteil von ca. 20x8 nm. Je nach Gattung befinden sich am Schwanzteil sechs kurze Schwanzfibern oder mehrere kurze Fortsätze (spikes). Dieses kurze Schwanzteil ist innerhalb der Ordnung Caudovirales charakteristisch für die Podoviridae, daher leitet sich der Name für die Familie vom griechischen podos (ποδός) für „Fuß“ ab.

Die Gattungen innerhalb der Podoviridae unterscheiden sich hinsichtlich der Organisation des Genoms, den Mechanismen der DNA-Verpackung und dem Vorhandensein einer DNA-Polymerase. Die Spezies der Gattung Φ29-ähnliche Viren besitzen im Gegensatz zu den anderen ein langgestrecktes, nicht-isometrisches Kapsid.

Neben den bislang vier Gattungen umfasst die Familie Podoviridae auch 33 weitere Spezies, die keiner Gattung zugeordnet werden.

Systematik

Die Familie Podoviridae umfasst folgende Gattungen und klassifizierte Spezies:

• Genus T7-ähnliche Viren (3 Spezies, 16 vorläufige Spezies)
  • Spezies Enterobacteria Phage T7 (T7-Phage)
  • Spezies Kluyvera Phage Kvp1
  • Spezies Pseudomonas Phage gh-1
• Genus P22-ähnliche Viren (1 Spezies, 12 vorläufige)
  • Spezies Enterobacteria Phage P22
• Genus Φ29-ähnliche Viren (3 Spezies, 10 vorläufige)
  • Spezies Bacillus Phage Φ29
  • Spezies Kurthia Phage 6
  • Spezies Streptococcus Phage Cp-1
• Genus N4-ähnliche Viren (1 Spezies)
  • Spezies Enterobacteria Phage N4 (E. coli Bakteriophage N4)

Besonderheiten

Die Gattung Φ29-ähnliche Viren besitzt ein analog den Adenoviridae und Tectiviridae an das Genom gebundenes terminale Protein, das dem Start der DNA-Replikation (Protein-priming) dient. Die Φ29-ähnliche Viren codieren für eine DNA-Polymerase Typ B, die der Polymerase II aus E. coli homolog ist.

Literatur

• C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004
• David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (eds.): Fields´ Virology, 4. Auflage, Philadelphia 2001

Weblinks

• Podoviridae: Genera und Spezies (NCBI)