DNA-Chip

DNA-Chip
Beispiel eines DNA-Chip mit etwa 40.000 Testfeldern.

Die DNA-Chip-Technologie nutzt Techniken aus der Halbleiterfertigung, um bekannte Gene auf einem fingernagelgroßen Plastik- oder Glasplättchen, dem Microarray, zu identifizieren und deren Aktivität zu messen.

In dem seit Ende der 1980er Jahre von Stephen P. A. Fodor entwickelten Verfahren können über 100.000 bekannte Gene in zu untersuchenden Patientenproben aus verschiedenen Geweben identifiziert werden. Die einzelnen Felder des Arrays sind mit einzelsträngigen DNA-Stücken beschichtet. Microarrays dienen der Bestimmung relativer Änderungen der Genexpression. Sie können aber auch zur Genotypisierung eingesetzt werden. Durch Zugabe der mit einem roten und grünen Fluoreszenzfarbstoff markierten Untersuchungsproben binden diese bei komplementärer Basenabfolge an die DNA im Chip. Die Position, Intensität und Wellenlänge der entstehenden Mischfarbe werden mit einer hochauflösenden Laserkamera detektiert und liefern Informationen über Unterschiede in der Expression der Gene zwischen den beiden Proben, z. B. in verschiedenen Organbereichen.

1994 brachte die Firma Affymetrix mit dem „HIV Gene Chip“ den ersten kommerziell erhältlichen DNA-Chip auf den Markt. Heute gibt es für einen breiten Anwendungsbereich spezielle Arrays für Genomische DNA, Plasmide, PCR-Produkte und lange Oligonukleotide.

Oberflächenchemie der Chips

Oft arbeitet man mit Aldehydslides, bei denen an der Oberfläche der Chips Aldehydgruppen angebracht sind, die die aminomodifizierten Oligos über eine Iminbildung binden (kovalente Bindung).

  • Epoxymodifizierte Slides: aminomodifizierte Oligos binden an der Epoxidgruppe unter Bildung eines Amins.
  • Streptavidin-modifizierte Slides: Biotin-modifizierte Oligos binden an dem Protein. (Das Tetramer Streptavidin besitzt vier Bindungsstellen, die je ein Biotin binden können)
  • NHS Slides: Diese Slides sind mit NHS–Estergruppen beschichtet. Durch ein aminomodifiziertes Oligo bildet sich ein Amid. (NHS = N-Hydroxysuccinimid)
  • Aminoslides: unmodifiziertes Oligo bindet an einer unbestimmten Stelle, während der Bestrahlung mit Licht, Wellenlänge λ = 370 nm (unbestimmte Reaktion).

Hersteller

  • Miltenyi Biotec, Geschäftsbereich MACSmolecular.
  • Agilent Life Sciences, die ursprünglich in Kooperation mit Affymetrix die Scanner bereitstellten.
  • Applied Biosystems, die ein System auf den Markt gebracht haben, das aufgrund der Chemolumineszenz-Technologie Genexpressionen nachweisen kann.
  • Combimatrix, die Life Science Firma der Acacia Research Holding.
  • Eppendorf Biochip Systems, die das Silverquant Detektionssystem für den colorimetrischen Nachweis von Signalen entwickelt hat.
  • febit biomed, eine Firma, die den weltweit ersten Random Access Genomic Analyzer (das Geniom) entwickelt hat.
  • GE Healthcare (ein Geschäftsbereich von GE), entstanden aus dem Zusammenschluss von GE Medical und Amersham Life Sciences 2004.
  • Illumina, eine Firma, die auf der Basis der Bead-Technologie arbeitet.
  • NimbleGen, ein Serviceanbieter für DNA-Analyse mit der Lizenz für die Maskless Array Synthesizer (MAS) Technologie, entwickelt von der Wisconsin Alumni Research Foundation (WARF).
  • PolyAn, eine Firma, die 3D-funktionalisierte Slides aus Polymer- bzw. Glas als Trägermaterial und fluoreszenzkodierte Beads für die molekulare Diagnostik entwickelt und produziert.
  • Schott Nexterion Microarray Solutions Die Produktgruppe Nexterion Microarray Solutions, ein Teilbereich der Schott Jenaer Glas GmbH, entwickelt, produziert und verkauft beschichtete und unbeschichtete Glassubstrate für die DNA- und Protein-Analyse.

Siehe auch


Wikimedia Foundation.

Игры ⚽ Поможем решить контрольную работу

Schlagen Sie auch in anderen Wörterbüchern nach:

  • DNA-Chip — DNA Chip …   Die deutsche Rechtschreibung

  • DNA-Chip —   [ tʃɪp], Genchip, DNA Array [ ə reɪ], zur schnellen Analyse von Nukleinsäuren (DNA, RNA) entwickelter, mit verschiedenen, genau positionierten DNA Molekülen beladener Kunststoff oder Glaschip. Zu den angehefteten DNA Molekülen komplementäre… …   Universal-Lexikon

  • DNA chip — chip n DNA microarray …   Medical dictionary

  • DNA-Chip —  DNA Chip  ДНК чип (также: ДНК биочип, ДНК микрочип, ДНК наночип)   Специальный чип, используемый для выявления генетических мутаций или сдвигов, диагностики заболеваний.    Биочип для американской армии, разработанный специалистами из… …   Толковый англо-русский словарь по нанотехнологии. - М.

  • DNA chip — noun a microchip that holds DNA probes that form half of the DNA double helix and can recognize DNA from samples being tested • Syn: ↑gene chip • Hypernyms: ↑chip, ↑microchip, ↑micro chip, ↑silicon chip, ↑microprocessor chip * * * …   Useful english dictionary

  • DNA-Chip-Technologie — Beispiel eines DNA Chip mit etwa 40.000 Testfeldern. Die DNA Chip Technologie nutzt Techniken aus der Halbleiterfertigung, um bekannte Gene auf einem fingernagelgroßen Plastik oder Glasplättchen, dem Microarray, zu identifizieren und deren… …   Deutsch Wikipedia

  • DNA chip — See: micro array …   Glossary of Biotechnology

  • Chip-Sequencing — ChIP Sequencing, also known as ChIP Seq, is used to analyze protein interactions with DNA. ChIP Seq combines chromatin immunoprecipitation (ChIP) with massively parallel DNA sequencing to identify the cistrome of DNA associated proteins. It can… …   Wikipedia

  • DNA Sequenzierung — ist die Bestimmung der DNA Sequenz, d. h. der Nukleotid Abfolge in einem DNA Molekül. Die DNA Sequenzierung hat die biologischen Wissenschaften revolutioniert und die Ära der Genomforschung (Genomik) eingeleitet. Seit 1995 konnte durch DNA… …   Deutsch Wikipedia

  • DNA-Sequenzierung — ist die Bestimmung der Nukleotid Abfolge in einem DNA Molekül. Die DNA Sequenzierung hat die biologischen Wissenschaften revolutioniert und die Ära der Genomik eingeleitet. Seit 1995 konnte durch DNA Sequenzierung das Genom von über 1000 (Stand:… …   Deutsch Wikipedia

Share the article and excerpts

Direct link
Do a right-click on the link above
and select “Copy Link”